Το Τμήμα Μ.Ι.Θ.Ε. έχει οργανώσει πλήθος συνεδρίων. Πρόσφατα το διεθνές συνέδριο Φιλοσοφίας για τα 50 χρόνια από τον θάνατο του Wittgenstein ("Wittgenstein in Delphi", Ιούνιος 2001), το 4o Athens-Pittsburgh Symposium Ιστορίας και Φιλοσοφίας της Επιστήμης & Τεχνολογίας, (Δελφοί, Ιούνιος 2003), το 3o Ελληνο-Τουρκικό Συμπόσιο Φιλοσοφίας και Ιστορίας της Επιστήμης (Απρίλιος του 2003) και το Διεθνές Συμπόσιο με θέμα «Αιτιότητα και Νόμοι της Φύσης» (Ιούνιος 2003). Το Σεπτέμβριο του 2002, το Τμήμα μας ανέλαβε την οργάνωση του 19ου Ετήσιου Συνεδρίου της European Association of Law & Economics, μιας από τις μεγαλύτερες ευρωπαϊκές επιστημονικές οργανώσεις.

Από το ακαδημαϊκό έτος 1995-96, το Τμήμα Μ.Ι.Θ.Ε. έχει καθιερώσει σειρά διαλέξεων με διαφορετικό θεματικό άξονα για κάθε ακαδημαϊκό έτος («Εξέλιξη», «Θεωρία», «Αλήθεια», «Ορθολογικότητα», «Σχετικισμός», «Διαφωτισμός», «Ελλάδα και Εσπερία: Στις ρίζες της Ευρωπαϊκής σκέψης», «Ιδεολογία και Επιστήμη», "Παράδοση και Εξέλιξη", "Φιλοσοφία και Επιστήμη", "Φιλοσοφικές, Ιστορικές, Πολιτικές και Κοινωνικές Συνιστώσες της Τεχνολογίας").